Для начала хотелось бы отметить, что особенно подвержены взломал нелицензионные и не обновляемые CMS, нелегально используемые шаблоны сайтов и различные модули!
Не редки случаи, когда из-за уязвимости одного сайта в аккаунте взламывается вся учетная запись (все сайты). Разделив сайты по разным учетным записям (CPanel), Вы существенно уменьшаете риск их взлома.
Реализовать это можно следующими способами:
1. Один хостинг план на 1 сайт;
2. Реселлинг хостинга.